Howdy, Stranger!

It looks like you're new here. If you want to get involved, click one of these buttons!

Sign In Register

Quick Links

Categories

Supported by

Computation details - ttests and correlations

emmacampbellemmacampbell
in JASP & BayesFactor

Hello,

I'm using Bayesian statistics for the first time on Independent Samples T-Tests and Kendall's Rank Correlations on JASP.

After I presented the results to my colleagues, one of them responded with the following comment : ''Before presenting any Bayesian analysis results, you need to present convergence diagnostics. In the methods you need to state how many MCMC simulations you ran, and in the results you need to show that the models converged.''

A recent paper (Kruschke, 2021) presented reporting guidelines and mentionned the importance of this information. They suggested reporting the Potential Scale Reduction Factor (PSRF or R-hat) and the ESS (number of steps).

I have looked everywhere I could think of for these values but have not found them in JASP options and outputs.

Thank you for your guidance,

Emma

Comments

  • EJEJ

    Hi Emma,

    For the regular t-test, no MCMC is needed. In fact we try to avoid MCMC whenever we can. Not all Bayesian inference uses MCMC! However, for Kendall's tau we do use a sampling-based methodology and you are right, we don't give Rhat, and I think we should. We do provide Rhat for our rank-based t-tests, and allow the possibility to set the number of samples. I'm not sure why we don't do that for Kendall's tau. Maybe there is a good reason, but I think it is simply an omission. We'll deal with this, thanks for pointing it out.

    Cheers,

    E.J.

  • emmacampbellemmacampbell

    Hi E.J.!

    Thanks so much for your quick answer!

    Just to confirm, at the moment, is there no way to obtain the Rhat for the Kendall's tau?

    Thanks again!

    Emma

  • EJEJ

    Hi Emma,

    Not at the moment in JASP, although perhaps you can with Johnny's R code -- I'll ask him.

    E.J.

  • emmacampbellemmacampbell

    Thank you so much ! Let me know :)

  • JohnnyBJohnnyB

    Hi @emmacampbell,

    The method that is currently in JASP is not MCMC-sampling based, so there are no convergence or sampling diagnostics to report. I am planning an overhaul of the analysis to update the (sampling-based) method, and then we will have these diagnostics. Please let me know if you have any further questions.

    Kind regards

    Johnny

  • emmacampbellemmacampbell

    Thank you for your answers. I very much appreciate you taking the time!

Sign In or Register to comment.
Sebastiaan Mathôt » v2.0.18 » Copyright 2011 — 2019 » Vanilla flavored » License

agen judi bola , sportbook, casino, togel, number game, singapore, tangkas, basket, slot, poker, dominoqq, agen bola. Semua permainan bisa dimainkan hanya dengan 1 ID. minimal deposit 50.000 ,- bonus cashback hingga 10% , diskon togel hingga 66% bisa bermain di android dan IOS kapanpun dan dimana pun. poker , bandarq , aduq, domino qq , dominobet. Semua permainan bisa dimainkan hanya dengan 1 ID. minimal deposit 10.000 ,- bonus turnover 0.5% dan bonus referral 20%. Bonus - bonus yang dihadirkan bisa terbilang cukup tinggi dan memuaskan, anda hanya perlu memasang pada situs yang memberikan bursa pasaran terbaik yaitu http://45.77.173.118/ Bola168. Situs penyedia segala jenis permainan poker online kini semakin banyak ditemukan di Internet, salah satunya TahunQQ merupakan situs Agen Judi Domino66 Dan BandarQ Terpercaya yang mampu memberikan banyak provit bagi bettornya. Permainan Yang Di Sediakan Dewi365 Juga sangat banyak Dan menarik dan Peluang untuk memenangkan Taruhan Judi online ini juga sangat mudah . Mainkan Segera Taruhan Sportbook anda bersama Agen Judi Bola Bersama Dewi365 Kemenangan Anda Berapa pun akan Terbayarkan. Tersedia 9 macam permainan seru yang bisa kamu mainkan hanya di dalam 1 ID saja. Permainan seru yang tersedia seperti Poker, Domino QQ Dan juga BandarQ Online. Semuanya tersedia lengkap hanya di ABGQQ. Situs ABGQQ sangat mudah dimenangkan, kamu juga akan mendapatkan mega bonus dan setiap pemain berhak mendapatkan cashback mingguan. ABGQQ juga telah diakui sebagai Bandar Domino Online yang menjamin sistem FAIR PLAY disetiap permainan yang bisa dimainkan dengan deposit minimal hanya Rp.25.000. DEWI365 adalah Bandar Judi Bola Terpercaya & resmi dan terpercaya di indonesia. Situs judi bola ini menyediakan fasilitas bagi anda untuk dapat bermain memainkan permainan judi bola. Didalam situs ini memiliki berbagai permainan taruhan bola terlengkap seperti Sbobet, yang membuat DEWI365 menjadi situs judi bola terbaik dan terpercaya di Indonesia. Tentunya sebagai situs yang bertugas sebagai Bandar Poker Online pastinya akan berusaha untuk menjaga semua informasi dan keamanan yang terdapat di POKERQQ13. Kotakqq adalah situs Judi Poker Online Terpercayayang menyediakan 9 jenis permainan sakong online, dominoqq, domino99, bandarq, bandar ceme, aduq, poker online, bandar poker, balak66, perang baccarat, dan capsa susun. Dengan minimal deposit withdraw 15.000 Anda sudah bisa memainkan semua permaina pkv games di situs kami. Jackpot besar,Win rate tinggi, Fair play, PKV Games