Howdy, Stranger!

It looks like you're new here. If you want to get involved, click one of these buttons!

Supported by

Inconsistent contrasts

Hi folks,

I’m writing because there are some disparities between JASP’s output for some contrasts compared to my hand calculation and SuperANOVA (my hand calculations and SuperANOVA agree with each other).

First, here is a contrast where all 3 are in agreement:

The first is a set of Helmert contrasts. The weights for the first contrast are (1, -.5, -.5) and the weights for the second contrast are (0, 1, -1)

SuperANOVA:

                     df   MSE   F-Value P-Value
Cent vs (Cov & Sac)   1  41.56   19.99   .0042
Cov vs. Sac           1  24.04   11.56   .0145

JASP:

                     estimate   SE   t-value P-Value
Cent - Cov, Sac     -2.632  0.589   -4.471   .004  (F = 19.99)
Cov - Sac           -1.733  0.510   -3.400   .014  (F = 11.56)

So, the p-values match, and the squared t-values match the F-values.

However, when I select “Repeated Contrast” in JASP, the answers don't match my hand calculations or SuperANOVA. Not only that, but notice that JASP's output for “Cov - Sac” comparison below does not match the JASP “Cov - Sac” when performing the Helmert Contrast above. Even stranger, the contrast of "Cent - Cov, Sac" above has the same values as "Cent - Cov" below!

Constrast weights: (1, -1, 0) and (0, 1, -1).

SuperANOVA:

                     df   MSE   F-Value P-Value
Cent vs Cov           1   9.81   4.72    .0729
Cov vs. Sac           1  24.04   11.56   .0145

JASP:

                     estimate   SE   t-value P-Value
Cent - Cov           -2.632  0.589   -4.471   .004   (F = 19.99)
Cov - Sac            -3.049  0.589   -5.180   .002   (F = 26.7)

What is JASP doing with the repeated contrast? Is it making some correction under-the-hood because the set of “Repeated Contrasts” is not orthogonal?

Comments

  • Hi Matt,

    I'll look into this. Basically we use R, but I'll ask the person who coded this to look into this issue specifically. Thanks for pointing it out.

    Cheers,
    E.J.

  • Hi Matt,

    I checked the code that is used to create the contrast weights and there seems to be an error in the way they are created at the moment. I fixed it now, and committed the change (see, https://github.com/jasp-stats/jasp-desktop/pull/1385/commits/700cd1dfbef5592752963da58ecbd7701659ae18) and this fix will be included in the next release (which we will make available in a week or so).

    Thanks a lot for checking this and reporting the error! It is really important to us that the community checks the output of the analyses for bugs; even though we do test the code and check for bugs it is always possible that little mistakes sneak in.

    Cheers,
    Ravi

Sign In or Register to comment.

agen judi bola , sportbook, casino, togel, number game, singapore, tangkas, basket, slot, poker, dominoqq, agen bola. Semua permainan bisa dimainkan hanya dengan 1 ID. minimal deposit 50.000 ,- bonus cashback hingga 10% , diskon togel hingga 66% bisa bermain di android dan IOS kapanpun dan dimana pun. poker , bandarq , aduq, domino qq , dominobet. Semua permainan bisa dimainkan hanya dengan 1 ID. minimal deposit 10.000 ,- bonus turnover 0.5% dan bonus referral 20%. Bonus - bonus yang dihadirkan bisa terbilang cukup tinggi dan memuaskan, anda hanya perlu memasang pada situs yang memberikan bursa pasaran terbaik yaitu http://45.77.173.118/ Bola168. Situs penyedia segala jenis permainan poker online kini semakin banyak ditemukan di Internet, salah satunya TahunQQ merupakan situs Agen Judi Domino66 Dan BandarQ Terpercaya yang mampu memberikan banyak provit bagi bettornya. Permainan Yang Di Sediakan Dewi365 Juga sangat banyak Dan menarik dan Peluang untuk memenangkan Taruhan Judi online ini juga sangat mudah . Mainkan Segera Taruhan Sportbook anda bersama Agen Judi Bola Bersama Dewi365 Kemenangan Anda Berapa pun akan Terbayarkan. Tersedia 9 macam permainan seru yang bisa kamu mainkan hanya di dalam 1 ID saja. Permainan seru yang tersedia seperti Poker, Domino QQ Dan juga BandarQ Online. Semuanya tersedia lengkap hanya di ABGQQ. Situs ABGQQ sangat mudah dimenangkan, kamu juga akan mendapatkan mega bonus dan setiap pemain berhak mendapatkan cashback mingguan. ABGQQ juga telah diakui sebagai Bandar Domino Online yang menjamin sistem FAIR PLAY disetiap permainan yang bisa dimainkan dengan deposit minimal hanya Rp.25.000. DEWI365 adalah Bandar Judi Bola Terpercaya & resmi dan terpercaya di indonesia. Situs judi bola ini menyediakan fasilitas bagi anda untuk dapat bermain memainkan permainan judi bola. Didalam situs ini memiliki berbagai permainan taruhan bola terlengkap seperti Sbobet, yang membuat DEWI365 menjadi situs judi bola terbaik dan terpercaya di Indonesia. Tentunya sebagai situs yang bertugas sebagai Bandar Poker Online pastinya akan berusaha untuk menjaga semua informasi dan keamanan yang terdapat di POKERQQ13. Kotakqq adalah situs Judi Poker Online Terpercayayang menyediakan 9 jenis permainan sakong online, dominoqq, domino99, bandarq, bandar ceme, aduq, poker online, bandar poker, balak66, perang baccarat, dan capsa susun. Dengan minimal deposit withdraw 15.000 Anda sudah bisa memainkan semua permaina pkv games di situs kami. Jackpot besar,Win rate tinggi, Fair play, PKV Games