Howdy, Stranger!

It looks like you're new here. If you want to get involved, click one of these buttons!

Supported by

BF from non-parametric z/t/p?

Dear JASPers,

I am working in (structural) brain imaging and the consensus that parametric methods should not be used, therefore a lot of bootstrapping, permutation testing, robust testing, etc is going on. As far as I learned from you at the JASP workshop, right now there is no way to do non-parametric t-tests with the R package/in JASP, but I still would like to do some BF based hypothesis testing and here is the idea I would like to ask you to check:

There was a post in Alex Etz's blog about the maximum BF regarding a given p-value. Is it OK conceptually that I do the non-parametric statistical analysis with frequentists methods, meanwhile correcting for the multiple comparisons and false-positives, etc., which is again a kind of consensus in the brain imaging community, and then I could calculate the theoretically maximum BF for the resulted z/t/whatever score?

The blog post: https://alexanderetz.com/2016/06/19/understanding-bayes-how-to-cheat-to-get-the-maximum-bayes-factor-for-a-given-p-value/

Cheers,
Szabolcs
(Sa-bol-ch)

Comments

  • Hi Szabolcs,

    We will soon include the Vovk-Sellke maximum ratio in JASP. I think this is a pretty general rule, but I am not sure whether it applies after you do multiple comparisons. This sort of depends on how you deal with multiple comparisons in a Bayesian framework. I would be more inclined to compute the maximum value from the original p-value, and then apply a multiplicity correction to that. But I am not 100% sure. Sorry about that; we are working to include more Bayesian nonparametric methods. I believe that George Karabatsos has a package for that...let me see...yes, this is the title: A Menu--Driven Software Package of {B}ayesian Nonparametric (and Parametric) Mixed Models for Regression Analysis and Density Estimation.

    Cheers,
    E.J.

  • Hi E.J.,

    Thanks for the reply and that reference!

    TBH I can't see a consensus in the brain imaging community how to do multiple comp. precisely. BF based hyp. testing is not that prevalent (in my area of research), so for the first try I am not worrying about the multiple comp. or any other correction step.
    Generally I will just calculate a t from a permutation test, then calculate the maximum BF.

    Cheers,
    Szabolcs

Sign In or Register to comment.

agen judi bola , sportbook, casino, togel, number game, singapore, tangkas, basket, slot, poker, dominoqq, agen bola. Semua permainan bisa dimainkan hanya dengan 1 ID. minimal deposit 50.000 ,- bonus cashback hingga 10% , diskon togel hingga 66% bisa bermain di android dan IOS kapanpun dan dimana pun. poker , bandarq , aduq, domino qq , dominobet. Semua permainan bisa dimainkan hanya dengan 1 ID. minimal deposit 10.000 ,- bonus turnover 0.5% dan bonus referral 20%. Bonus - bonus yang dihadirkan bisa terbilang cukup tinggi dan memuaskan, anda hanya perlu memasang pada situs yang memberikan bursa pasaran terbaik yaitu http://45.77.173.118/ Bola168. Situs penyedia segala jenis permainan poker online kini semakin banyak ditemukan di Internet, salah satunya TahunQQ merupakan situs Agen Judi Domino66 Dan BandarQ Terpercaya yang mampu memberikan banyak provit bagi bettornya. Permainan Yang Di Sediakan Dewi365 Juga sangat banyak Dan menarik dan Peluang untuk memenangkan Taruhan Judi online ini juga sangat mudah . Mainkan Segera Taruhan Sportbook anda bersama Agen Judi Bola Bersama Dewi365 Kemenangan Anda Berapa pun akan Terbayarkan. Tersedia 9 macam permainan seru yang bisa kamu mainkan hanya di dalam 1 ID saja. Permainan seru yang tersedia seperti Poker, Domino QQ Dan juga BandarQ Online. Semuanya tersedia lengkap hanya di ABGQQ. Situs ABGQQ sangat mudah dimenangkan, kamu juga akan mendapatkan mega bonus dan setiap pemain berhak mendapatkan cashback mingguan. ABGQQ juga telah diakui sebagai Bandar Domino Online yang menjamin sistem FAIR PLAY disetiap permainan yang bisa dimainkan dengan deposit minimal hanya Rp.25.000. DEWI365 adalah Bandar Judi Bola Terpercaya & resmi dan terpercaya di indonesia. Situs judi bola ini menyediakan fasilitas bagi anda untuk dapat bermain memainkan permainan judi bola. Didalam situs ini memiliki berbagai permainan taruhan bola terlengkap seperti Sbobet, yang membuat DEWI365 menjadi situs judi bola terbaik dan terpercaya di Indonesia. Tentunya sebagai situs yang bertugas sebagai Bandar Poker Online pastinya akan berusaha untuk menjaga semua informasi dan keamanan yang terdapat di POKERQQ13. Kotakqq adalah situs Judi Poker Online Terpercayayang menyediakan 9 jenis permainan sakong online, dominoqq, domino99, bandarq, bandar ceme, aduq, poker online, bandar poker, balak66, perang baccarat, dan capsa susun. Dengan minimal deposit withdraw 15.000 Anda sudah bisa memainkan semua permaina pkv games di situs kami. Jackpot besar,Win rate tinggi, Fair play, PKV Games